种鸭的配种方法有：自然配种法和人工授精法。
现阶段种鸭养殖的配种方式大多以鸭群公母比例1∶5左右的自然配种方式比较普遍。人工授精法虽然可以大大降低因饲养种公鸭而投入的费用，但需要多投入笼舍、器械、人工的费用。并且人工授精的方式不如自然配种法所产种蛋的受精率高，一般仅有60%～70%左右。